自由高达的事情，终究还是惊动了NERV背后的SEELE。
但是在夺魂咒的控制下，碇源堂应对自如将所有的锅都甩给M国，认为是他们将精力放在使徒上小看了各国高层，在SEELE渗透各国的同时，各国也未必没有渗透SEELE窃取技术。
甚至在窃取的技术的基础上，青出于蓝而胜于蓝。
碇源堂的这一番甩锅，成功让SEELE将部分精力放在对各国的秘密调查上。
出现一个自由高达已经让他们无法忍受，万一出现更多自由高达，无论对于SEELE还是NERV都是灭顶之灾，毕竟各国明面上统治着全球人类，失去科技和经济的绝对优势，他们怎么在幕后掌控全球局势？
李牧这边成功转移了SEELE的注意力，NERV这边也开始转型。
虽然NERV是SEELE的附属机构，NERV存在的目的也是最终灭绝全人类。
但是整个NERV知道这个真相的只有极个别人，剩下的都以为他们的工作是借助EVA抵御使徒守护人类，根本不知道他们在不知不觉间成为了推进人类走向灭亡的刽子手。
李牧用了几天时间，借助舰载光脑完全掌控了NERV的超级电脑三贤人超级计算机系统，然后入侵掌控了全球的分系统，虽然这个世界的克隆技术和武器技术都非常高端，但是电脑技术和舰载光脑相比那就差远了。
所以借助舰载光脑，他能秘密掌控全球所有的信息通讯。
同时在这几天时间，他还找到了SEELE潜入NERV负责监视的所有暗子。
这些暗子，李牧全部都秘密抓捕使用遗忘咒和摄神取念洗脑。
精神污染和夺魂咒，会因为这个世界人类灵魂的外壳和灵魂物质的作用逐渐失效。
但是直接针对记忆而不针对精神意识，那么进行的修改就不会逐渐失效。
通过洗脑，这些SEELE的暗子全部都已经更改效忠目标。
从此以后他们传回去的所有消息，都是李牧想让SEELE知道的消息，他不想让SEELE知道的事情，除非SEELE派人来NERV进行实地调查，才有可能知道NERV已经完全脱离SEELE的掌控。
成功摆脱了SEELE，李牧第一时间将源自先驱一族的生化技术拿了出来。
然后调集整个基地的力量，对现有的零号机和初号机进行改造。
具体过程为强化零号机，然后彻底改造初号机。
EVA零号机的主体跟自由高达一样都是亚当的克隆体，所以强化过程跟自由高达相差不多，只是因为投入资源较少，零号机整体上跟自由高达完全没有可比性。
最终只是简单强化了一下，李牧甚至都没有将其转化为火种EVA。
但是到了初号机，李牧选择投入了不逊色于自由高达的巨大投入。
因为随着绫波丽驾驶自由高达越来越久，她虽然对自由高达非常满意，但是总感觉无法跟自由高达完美契合，为什么会这样李牧很清楚，因为绫波丽本质上就是莉莉丝的转世，自由高达的核心却是亚当。
所以李牧开始改造初号机，因为初号机本身就是切下了莉莉丝的下半身制造而成。
初号机才是最适合绫波丽的EVA，经过长达一个星期的改造，初号机跟原来相比已经面目全非，全新的初号机看起来和自由高达相差不多，转化成火种EVA最终甚至消耗了三万卡火种源力。
成为火种EVA，自然不适合再叫初号机。
所以，李牧改了名字。
【天使高达：半火种炼金生命】
【品质：青色天级】
【属性：取决于驾驶者，最高强度不超过第二使徒莉莉丝】
【装备：热能光束炮、空间震动波】
【主动技能：AT力场】。
【主动技能：幻影移形】
【被动技能：生命补完】
单纯从属性来看，天使高达除了初始品质高一些，其他跟自由高达没有太大区别，而自由高达吞噬了莉莉丝六分之一身体，现在品质也早已经从青色地级提升到青色天级。
所以自由高达和天使高达，两台火种EVA的实力相差无几。
如果一定要进行细分，那也就是自由高达AT力场更强，天使高达的AT力场更容易操纵。
从天使高达诞生这一天开始，李牧就将天使高达交给绫波丽，他则驾驶自由高达，每天白天跟绫波丽一起训练EVA的协同作战，晚上就如同一家人一样吃饭睡觉生活在一起。
幸福的生活总是短暂，因为在人类监测范围的第三使徒即将复苏。
李牧知道，EVA的主线剧情要展开了。
第三新东京市的建立，主要目地就是将亚当制造的使徒给引过来逐个歼灭。
因为莉莉丝降临对全球造成的第一次冲击，所有使徒都陷入了沉睡。
因为人类想要捕获沉睡的亚当，亚当受到刺激不惜引爆生命之果蕴含的能量引发了第二次冲击，直接导致全球范围的巨大环境灾难，甚至就连亚当自身都虚弱成最初始的胚胎状落在人类手里。
亚当虽然凉了，但是他制造的十四个使徒却在陆续苏醒。
出于本能，苏醒后的使徒会选择回归亚当体内彼此融合恢复巅峰。
双方一旦接触就会导致亚当复苏，然后再次释放出生命之果的力量毁灭全球人类。
这也就是第三次冲击，死海文书预言的未来末日。
SEELE虽然计划毁灭人类，但是人类怎么死这一点非常关键。
如果是使徒和亚当接触，引爆生命之果的能量毁灭全球生命，人类就相当于白白死了再也不复存在，这样的结果人类自然无法接受，纵然是SEELE那些宗教疯子也不答应。
所以SEELE设计了人类补完计划，这个计划需要猎杀使徒夺取生命之果。
然后将生命之果融入莉莉丝体内，让莉莉丝苏醒回收所有分散出去的人类，进而融合完整的生命之果和智慧之果成为神灵，从此所有人类舍弃身体，只留下灵魂在神的体内得到永生。
SEELE想达成这个目的，就要将亚当的使徒一个个击杀。
想将使徒吸引到第三新东京市送死，就要让使徒认为亚当就在第三新东京市。
所以这一天，SEELE派人送来了模拟亚当灵魂波动的机器。
只要激活这个，陆续苏醒的使徒就会被欺骗过来。
空有生命之果没有智慧之果，空有力量没有足够的智慧，从一开始就注定了这些使徒的悲剧，然而更悲剧的还是那些什么都不知道被人随意决定生死的普通人。
晶晶走到唐三身边，就在他身旁盘膝坐下，向他轻轻的点了点头。
唐三双眼微眯，身体缓缓飘浮而起，在天堂花的花心之上站起身来。他深吸口气，全身的气息随之鼓荡起来。体内的九大血脉经过刚才这段时间的交融，已经彻底处于平衡状态。自身开始飞速的升华。
额头上，黄金三叉戟的光纹重新浮现出来，在这一刻，唐三的气息开始蜕变。他的神识与黄金三叉戟的烙印相互融合，感应着黄金三叉戟的气息，双眸开始变得越发明亮起来。
阵阵犹如梵唱一般的海浪波动声在他身边响起，强烈的光芒开始迅速的升腾，巨大的金色光影映衬在他背后。唐三瞬间目光如电，向空中凝望。
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顿时，”轰”的一声巨响从天堂花上爆发而出，巨大的金色光柱冲天而起，直冲云霄。
不远处的天狐大妖皇只觉得一股惊天意志爆发，整个地狱花园都剧烈的颤抖起来，花朵开始迅速的枯萎，所有的气运，似乎都在朝着那道金色的光柱凝聚而去。
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他脸色大变的同时也是不敢怠慢，摇身一晃，已经现出原形，化为一只身长超过百米的九尾天狐，每一根护卫更是都有着超过三百米的长度，九尾横空，遮天蔽日。散发出大量的气运注入地狱花园之中，稳定着位面。
地狱花园绝不能破碎，否则的话，对于天狐族来说就是毁灭性的灾难。
祖庭，天狐圣山。
原本已经收敛的金光骤然再次强烈起来，不仅如此，天狐圣山本体还散发出白色的光芒，但那白光却像是向内塌陷似的，朝着内部涌入。
一道金色光柱毫无预兆的冲天而起，瞬间冲向高空。
刚刚再次抵挡过一次雷劫的皇者们几乎是下意识的全都散开。而下一瞬，那金色光柱就已经冲入了劫云之中。
漆黑如墨的劫云瞬间被点亮，化为了暗金色的云朵，所有的紫色在这一刻竟是全部烟消云散，取而代之的，是一道道巨大的金色雷霆。那仿佛充斥着整个位面怒火。
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